| 機關各部門 | 醫院 | 學院 | 學部,研究、教輔機構 | 其他 |
| 黨委辦公室(校長辦公室、機關黨委、檔案館) | 第一醫院 | 研究生學院 | 臨床實踐教學部 | 科技總公司 |
| 紀委(監察處、巡察辦、省監委駐河北醫科大學監察專員辦公室) | 第二醫院 | 基礎醫學院 | 馬克思主義學院 |
|
| 黨委組織部 | 第三醫院 | 藥學院 | 外語部 |
|
| 黨委宣傳部 | 第四醫院 | 公共衛生學院 | 體育教學部 |
|
| 黨委統戰部 | 口腔醫院 | 中西醫結合學院 | 基礎醫學研究所(醫學與健康研究院) |
|
| 工會 |
| 護理學院 | 中西醫結合研究所 |
|
| 團委 |
| 法醫學院 | 醫教協同與醫學教育研究中心(醫學史研究中心) |
|
| 發展規劃處 |
| 醫學技術學院 | 技術轉移中心 |
|
| 人事處 |
| 醫學影像學院 | 教師發展中心 |
|
| 教務處(招生辦公室) |
| 臨床學院 | 網絡與教育技術中心 |
|
| 科技處 |
| 國際教育學院 | 教學實驗中心 |
|
| 學生處(就業指導中心) |
| 繼續教育學院 | 期刊社 |
|
| 國際合作與交流處 |
| 鄉村醫師學院 | 圖書館 |
|
| 財務處 |
| 第一臨床醫學院 | 實驗動物學部 |
|
| 國有資產與實驗室管理處 |
| 第二臨床醫學院 |
|
|
| 后勤管理處 |
| 第三臨床醫學院 |
|
|
| 審計處 |
| 第四臨床醫學院 |
|
|
| 安全工作處 |
| 口腔醫學院 |
|
|
| 離退休辦公室 |
| 全科醫學院 |
|
|